2018년 1월 12일 금요일

새로운 유전체 분석 서비스, GoSeqIt Tools

이틀 전, 낯선 곳으로부터 이메일이 왔다.

New web-platform for WGS-based bacterial characterisation

생명과학 연구를 위한 각종 키트나 서비스에 대한 광고성 메일을 종종 받지만, 내가 평소에 하는 업무와 관련하여 이렇게 매우 구체적인 안내 메일이 온 것은 매우 드문 일이다. 웹 주소(http://www.goseqit.com/)를 보면 전형적인 회사이다. 클릭을 하여 보았다. 덴마크 공과대학교(DTU)의 Center for Genomic Epidemiology(CGE)에서 매우 최근에 창업한 기업이었다. CGE에서는 20 가지 이상의 분석 도구를 보유하고 있는데, 이를 좀 더 사용자 친화적 및 안정적으로 제공하기 위하여 기업화를 한 것으로 보인다.

GoSeqIt에서 현재 서비스하는 분석 도구는 전부 peer-review journal을 통하여 발표된 것으로 다음과 같다.

  1. Species identification
  2. Multilocus sequence typing (MLST)
  3. Identification of acquired antibiotic resistance genes and point mutations in chromosomal genes causing antimicrobial resistance
  4. Identification of virulence factors for Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Enterococcus, and Listeria
  5. Identification of plasmids for Enterbacteriaceae and gram-positive bacteria
  6. Plasmid multilocus sequence typing, pMLST, for plasmids of the type IncN, IncHI1, IncHI2, IncF, and IncA/C
  7. Identification of serotype for E. coli
  8. Identification of FimH type for E. coli
GoSeqIt에서 사용하는 데이터베이스는 CGE의 것보다 더 빨리 업데이트가 된다고 한다. 또한 아마존 클라우드 안에서 돌아가므로 매우 빠르고 안정적이라고 자랑을 하였다. 유튜브에서는 등록 및 사용 방법에 대한 동영상이 올라와 있다.
새로 등록한 사용자에게는 100개의 무료 CoSeqIt "coin"을 지급한다고 하였다. 등록을 하니 application을 돌릴 때마다 비용이 나가는 것처럼 보였다. 등록 후 첫 화면에서  "내 지갑"을 가 보았다.


코인의 최소 구입 단위는 200(125 달러)이다. 파일은 웹 브라우저 내에 drop을 하여 제출한다. 새로운 파이프라인의 가격은 1~4 코인 수준이고, ContigAnalyzer는 무료이다. 9개 도구 중에서 원하는 것을 골라서 파이프라인을 만들고, 새 프로젝트를 설정한 다음, 파일을 업로드하여 분석을 진행하면 되는 구조이다. 샘플 파일에 비례하여 비용이 올라가는 것 같지는 않다. 왜냐하면 코인 지불은 파이프라인 생성 단계에서 하기 때문이다. 업로드 가능한 샘플 파일은 high-throughput sequencing raw data는 안되고 오직 contig/genome level의 파일인 것으로 파악된다. 

ContigAnalyzer tool 하나만으로 구성된 파이프라인을 만든 다음 어제 NCBI에 등록하느라 사용했던 박테리아 genome assembly 두 개를 올려보았다. 리포트는 웹 브라우저에서 볼 수도 있고 PDF 파일로 다운받을 수도 있다.

유료라는 것이 아쉽지만 매우 신선한 발상의 서비스가 아닌가? 여러개의 샘플 파일을 올린 경우 하나로 통합된 리포트가 나온다면 더 좋을 것이다. 앞으로 관심을 갖고 활용해 보련다.


 

2018년 1월 7일 일요일

독서 기록 - 전문가의 독재(The Tyranny of Experts) 및 대량살상 수학무기(Weapons of Math Destruction)

내가 즐겨 읽는 책은 바로 이런 부류의 것들이다. 요즘은 여기에 더하여 소설책을 읽으려고 노력하는 중이다.


전문가의 독재(The Tyranny of Experts)

  • 윌리엄 이스털리(링크) 지음
  • 김홍식 옮김
'빈 서판(書板; 라틴어 tabula rasa, 영어로는 blank slate)'이라는 개념이 있다. 종이와 펜이 귀하던 시절, 학생들은 수업시간에 서판에 글씨를 쓰고 지우고를 반복했을 것이다. 빈 서판 이론은 인간의 본성은 타고난 것이 적다는 철학적 이론이다. 즉 깨끗이 닦인 빈 서판에 글씨를 쓰듯이 교육을 통해서 인간에게는 그 어떤 생각이든 가르칠 수(주입할 수) 있고 또 어떤 사람이든 될 수 있다는 뜻이다. 경제발전으로 가난한 나라를 일으켜 세우는 것도 빈 서판에 글씨를 써 내려가듯이(역사적·지리적 맥락을 무시하고) 가능하다는 것도 이 이론에 바탕을 둔 것으로 본다. 즉 테크노크라트(기술관료)적 접근 - 전문가들이 문제점을 진단하고 빈곤 해결을 위한 방안을 수립하여 정부는 이를 강력하게 추진 - 이 반드시 필요하고 그 과정에서 어느 정도의 '인자한 독재자(우리에게는 박정희라는 사례가 있다)'가 능력을 발휘한다는 것이 일반적인 믿음이다. 그러나 저자 이스털리는 이것은 일종의 환상이며, 가난한 나라에 부족한 것은 기술이나 정책이 아니라 개인의 권리라는 것을 주장하고 있다.

부유한 서방 세계에서 20세기 초반 가난한 나라에 대한 원조가 시작된 것은 보편적인 인권 개념과는 무관한 것이었다. 동아시아에서 존재했었던 '인자한 독재자'에 의한 경제적 발전은 허구이다. 국가의 중요성을 부정하는 것은 아니지만, 가난한 자들의 권리를 신장시키는 것이 경제적 번영을 일구어 나가는 근본적인 요인이 된다는 것이다.

빈곤이 전문적인 능력의 부족에서 비롯된다고 믿는 테크노트라트적 환상은 새로운 권력과 정당성을 자연스럽게 국가에게 안긴다. 그러나 기술적 문제는 빈곤의 여러 <증상> 중 하나이지, 빈곤의 <원인>이 아니며, 빈곤의 원인은 정치적, 권리적 권리의 부재라는 것이 이 책의 일관적인 주장이다.

15세기 중반까지만 해도 유럽보다 우월한 삶을 영위했던 중국은 왜 그 후에 몰락하였나? 똑같은 식민지였으면서도 왜 북미와 남미는 이렇게 다른 길을 걸어가게 되었나? 현재의 경제적 번영은 개방과 국외 무역을 중시하고 엘리트의 독식 구조를 타파하며 개인의 권리를 위해 오랜 기간 투쟁해온 공동체·나라들의 손에 돌아갔다는 것을 역사가 증명하고 있다.

이 책은 특히 탐욕스런 자본주의의 정신의 지주로 일컬어지는 애덤 스미스의 인용문은 실제로 가장 잘못 이해되고 있는 것이라고 하였다(p.375~).
개인들은 최대한 많은 가치를 생산하려고 부단히도 자기 일에 주력한다. 자신의 이득만을 보고 하는 일이지만, 다른 많은 일에서도 그렇듯 개인은 이런 식으로 보이지 않는 손에 인도되어 자신이 전혀 의도하지 않았던 목적에 기여하게 된다. 그가 의도하지 않아다고 해서 꼭 사회에 나쁜 것은 아니다. 사람들이 공익에 기여하기를 바랄 때보다, 오히려 그런 생각 없이 자신의 이익을 추구하는 바로 그 행위가 공익에 더 효과적으로 기여할 때가 많다.
이 인용구에 대한 가장 큰 오해는 스미스가 <탐욕은 좋은 것>이라고 생각했다는 것이다. 하지만 그는 독점의 폐해를 분명히 지적하였다. 스미스가 주장한 자유 시장은 기존의 상인을 더 부자가 되게 만들자는 것이 아니라 그들의 독점권과 특권을 박탈하여 그들의 부를 줄이자는 것이었다. 그가 주양한 자유 무역은 빈곤층을 위한 저렴한 식량의 수입을 촉진하여 그러한 거대 지주들을 약화시키는 것이었다(p.377).

이 책의 2장에서 소개한 프리드리히 하이에크와 군나르 뮈르달에 대한 공부가 숙제로 남았다. 아울러서 진정한 '자유'와 '권리'란 무엇인지에 대해서도 말이다. 특히 우리나라만큼 자유주의의 의미가 왜곡되어 쓰이는 곳도 흔치는 않을 것이다.

대량살상 수학무기(Weapons of Math Destruction)

수학이라는 멋진 도구를 현실 세계에 반영한다는 것은 '더 멋진' 일이 아닐 수 없다. 그러나 이 도구가 자본에 종속되어 사람들의 권리를 침해하고 약탈자로 둔갑하기 시작하였다. 그럼에도 불구하고 우리나라에서는 공공 데이터(요즘 유행하는 빅데이터)를 이용하여 비즈니스 기회를 창출하지 못하면 제4차 산업혁명시대에 당장 뒤쳐질것이라는 불안감을 이용한 마케팅이 횡행하고 있다.

방대한 분량의 데이터를 분석하여 지혜로운 판단을 내리려는 것은 매우 합리적인 행동이다. 이 과정에서 수학과 인공지능이라는 기법이 필수적으로 쓰인다. 이를 위해서는 데이터를 이용하여 어떤 수학적 모델(모형)을 만드는 것이 필요하다. 서두에서 저자는 다음과 같이 분명하게 밝혔다.
우리는 개인이든 기업이든 누가 모형을 만들었는지, 그리고 개발자가 모형을 통해 성취하려는 목표가 무엇인지 알아야 한다.
개인은 저마다 다 다르다. 인간의 뇌는 이를 적당히 구분짓는 놀라운 능력을 갖고 있다. 아마 이것은 맹수에 쫓기고 야만인의 위협을 받던 오래 전에 진화적으로 만들어진 능력일 것이다. 내가 생활자금이 부족해서 금융권으로 대출 심사를 받으려고 하는데, '당신은 이러이러해서 부적격자이므로 대출이 불가합니다'가 아니라 '당신은 우리가 수집한 정보에 의하면 이러이러한 세부 그룹에 속하는 사람이고, 그 그룹은 대출금을 상환할 능력이 없다는 것이 우리의 판단이니, 대출이 불가합니다'라는 판정을 받는다면?

이 책은 수학이라는 도구 자체를 불신하는 것은 아니다(제목만 보면 오해를 하기 쉽다). 요리사의 손에 들린 칼과 강도의 손에 들린 칼이 그 의미가 다르듯이, 도구를 쥔 자가 어떤 의도를 갖고 있는지를 중요시해야 한다. 피터 드러커가 이런 말을 했다고 한다.
If you can't measure, you can't manage. (측정하지 못하면 관리하지 못한다 - 즉 개선할 수 없다)
이것에 대한 반론(fobes에 실린 글 - 나중에 읽어보자)도 물론 존재한다.

우리는 모두 측정과 줄 세우기의 노예가 되었다! 교육 예산이 부족하니 무능한 교사를 퇴출하기 위해서, 연구 예산이 부족하니 불량한 과제를 자르기 위하여, 기업의 경영상태가 부실하니 저성과자를 내보내기 위하여, 신입사원 50명을 뽑는데 2,000명이 원서를 냈으니 이중에서 적합한 자를 사전 선별하기 위하여...

생존권이 달린 문제를 놓고 누군가는 이들을 줄을 세워 잘라야 한다. 하지만 뒷말이 없는 공정한 기준을 만드는 것 자체가 힘들고, 선정 과정에 들여야 할 노력도 엄청나다. 이를 위해서 나름대로 정교하게 만들어졌다고 주장하는 수학적 모델을 도입하는 것으로 면죄부를 주려한다. 그러나 이러한 수학적 모델이 이용하는 변수들은 불완전하고, 변수를 수집하는 과정에서 인권 침해의 여지가 다분하고, 알고리즘도 완벽하지 않으며, 영업 기밀이라는 이유로 공개는커녕 피드백도 허용하지 않는다. 과거에 인기를 끌었던 비과학적 골상학에 디지털이라는 기술을 입힌 것에 불과하다. 이 책에서는 이와 관련한 많은 사례를 소개하였다.

이 책의 223쪽에 나온 사례를 소개해 보겠다. 뱅크오브아메리카에서는 팀별 생산성의 차이가 나는 이류를 알기 위해 직원들에게 socio-metric batch를 6주간 착용하여 그들의 동선과 어조 및 제스쳐를 16 밀리초 간격으로 측정하였다. 그 결과는 놀라웠다. 동료간의 대화가 많은 팀이 고객의 요구에 가장 신속하고 효율적으로 반응했다고 한다. 만약 근무태도에 대한 일반적인 수학 모형을 만든다면 동료와 대화하는데 많은 시간을 들인 사람은 단순히 노닥거리면서 시간을 낭비한 사람으로 낙인을 찍게 될 것이다.

빅데이터를 이용하면 헬스케어 또는 웰니스 분야에서 엄청난 사업 기회가 생길 것이라고 많은 사람들이 기대를 한다. 그러나 이것도 프라이버시 침해와 강제성 문제가 생길 수 있다. 어렵사리 직업을 구한 뒤 정식으로 입사하기 전에 건강검진을 받는 것을 요즘은 당연한 것으로 생각하지만, 조금만 다른 방법으로 생각해 본다면 이것은 또 다른 차별적 요인일 수도 있는 것이다.

337쪽의 결론 부분을 이용하는 것으로 독서 기록을 마치고자 한다.
데이터 처리 과정은 과거를 코드화할 뿐, 미래를 창조하지 않는다. 미래를 창조하려면 도덕적 상상력이 필요하다. 그런 능력은 오직 인간만이 가지고 있다.
(339쪽) 2008년 금융시장이 붕괴한 이후에 금융공학자 이매뉴얼 더만과 폴 윌모트는 실제로 모형 개발자를 위한 히포크라테스 선서를 작성했다.

  • 나는 내가 세상을 만드는 것이 아니며, 세상이 내 방정식을 따르지 않음을 명심하겠습니다.
  • 나는 가치를 추산하기 위해 모형을 대담하게 사용할지언정, 수학에 지나치게 감동받지는 않겠습니다.
  • 나는 이유를 설명하지 않고는 우아함때문에 현실을 결코 희생시키지 않겠습니다.
  • 나는 내 모형을 사용하는 사람들이 그 정확성에 대한 거짓된 위안을 갖도록 하지 않겠습니다. 대신에 나는 모형에 이용된 가정과 간과된 점들을 분명히 밝히겠습니다.
  • 나는 내 일이 사회와 경제에 지대한 영향을 끼칠 수 있음을, 그런 영향의 상당 부분이 나의 이해 수준을 능가하는 것임을 명심하겠습니다.

2018년 1월 5일 금요일

사람이 센서(sensor)가 된 시대

과거에는 개인과 관련된 기록이라 하면 학창시절의 성적표나 생활기록부, 주거지 정보, 주변사람들의 평판, 손으로 쓴 글씨, 직장의 인사 기록, 인화한 사진 정도가 전부였을 것이다. 이런 기록이 이제 디지털화하여 전송과 보관 및 분석이 용이한 형태로 바뀌고 있다. 게다가 모바일 기기나 인터넷에 접속된 PC를 이용하여 하루 동안에만도 엄청난 데이터를 생산하게 되었다. 또한 의료나 금융, 쇼핑 등과 관련한 수많은 정보가 의식하지 못하는 사이에 이러한 기기를 통하여 어디론가 흘러간다.

구글에서 humans as sensors로 검색을 해 보라. 상당히 많은 글들을 접하게 될 것이다.

사람은 데이터를 만드는 주체이기도 하지만 유선전화, 모바일 기기 그리고 PC를 사용하면서 아주 자연스런 데이터의 전송 포인트가 되었다. 즉 컴퓨터에 연결된 '센서'가 되기를 자처한 것이다. 이를 이용하면 거대한 규모의 비즈니스 기회를 창출하는데 도움이 될 수 있다. 이렇게 양산된 정보를 기업에서 편하게 쓸 수 있게 해 달라는 요구도 점점 커지는 추세이다. 'AI'를 이용하여 '빅데이터'를 주무르지 않으면 '제4차 산업혁명시대'에 뒤쳐질지도 모른다는 '불안감 마케팅'이 우리 주변을 안개처럼 휘감고 있는 것이다.

인간은 데이터 자체이기도 하고, 데이터를 수집하는 센서이기도 하고, 이를 인터넷 저편의 어딘가로 자발적으로 보내주는 일종의 data acquisition board이기도 하다. 90년대 후반 철없던 postdoc 시절에 매만졌던 Advantech과 LabVIEW 제품이 떠오른다.

경향신문의 2018 신년기획 "헌법 11.0 다시 쓰는 시민계약"에서는 지난 1월 3일 인간은 데이터, IT 기업이 '신'이된 세상이라는 기사(링크)를 실었다. 내 정보를 내가 통제할 수 있어야 한다는 기본권이 현재의 헌법에서 충분히 보장되고 있는가? 모든 것이 경제 논리에 파묻히고 있다. 조금 전에 읽기를 마친 캐시 오닐의 책 <대량살상 수학무기(Weapons of Math Destruction - 대량살상무기는 Weapons of Mass Destruction이다)>은 많은 것을 생각하게 하였다. 이 책에 대한 독서 기록은 별도의 블로그 포스트로 남길 예정이다.

개방은 미덕일 수 있다. 그러나 이윤 증대, 비용 감소만을 목표로 하는 기업에서 이를 가져다가 불완전한 데이터 모형을 만들고 이를 개선할 피드백은 전혀 받지 않은채 알고리즘을 만들며, 이를 사용하여 대중을 제멋대로 구분, 대출광고를 뿌리고 채용 과정에서 불이익을 받게 만든다. 책에서 소개한 많은 사례 중 이것은 극히 일부이다. 그런데 정작 불이익을 당한 우리는 그러한 데이터 모형과 알고리즘에 대해서 알지 못한다. 기업은 개방화를 외치면서 우리의 데이터를 갖다 쓰지만, 그들이 구축한 방법은 영업 기밀이라는 이유로 개방하지 않는 이중 잣대를 들이대는 것이다.

수학과 IT는 멋진 도구이다. 그 자체는 가치 중립적이다. 마찬가지로 칼과 망치와 톱도 멋진 도구이다. 그러나 흉악범의 손에 칼과 망치와 톱이 들리면 무시무시한 흉기로 변한다. 이 도구는 요리사와 목수의 손에서 선한 의도로 쓰일 때 비로소 인류에게 유익한 역할을 할 수 있는 것이다.

생각하지 않고 저항하지 않으면 우리의 기본적인 권리가 잊혀진다. 더 이상 수동 소자가 되기를 자처하지 말자. 인간은 지성적인 존재이므로.

2018년 1월 4일 목요일

우분투 노틸러스에서 SSH로 다른 컴퓨터 연결하기

개인적으로 유전체 시퀀싱 자료를 꽤 많이 보유한 편이라서 나름대로의 백업 대책을 수립하여 이를 준수하기 위해 노력하고 있다. 아주 오래된 것은 SATA HDD에 기록하여 문짝이 달린 책장에 보관하며, 가끔 꺼내보는 것은 DAS에, 최근 것은 주로 사용하는 리눅스 컴퓨터의 파일 시스템 안에 둔다.

꽤 오래전에 시퀀싱한 raw data file을 사용할 일이 생겨서 책장에서 HDD를 꺼내들었다. 데이터 파일 이름이 s_4_sequence의 형태이니 정말 오래전의 일루미나 자료가 아니겠는가? 아마도 2009년 말에 시퀀싱이 된 것으로 기억한다. 새로텍 PROBOX Docking Station(DP-20U3-6G)에 HDD를 장착한 뒤 우분투 데스크탑(14.04)이 설치된 컴퓨터에 연결하였다. 업무용 컴퓨터(Windows 7)에 연결하면 직장의 USB 매체 관리 시스템에 등록을 요청해야 하므로 좀 번거롭다. 리눅스를 통해 우회하는 것은 보안 규정 위반인가? 그렇다고 볼 수는 없다. 만약 그렇다면 리눅스를 쓰는 것 자체를 금지해야 할 것이다.


성공적으로 인식이 되었으니 이를 주 작업용 서버(진공관 앰프에 관심이 많던 시절에 구입한 것이라서 tube라고 부름)로 전송해야 한다. 터미널 창을 열고 scp 명령을 입력하려다가 얼핏 이런 생각이 들었다. '노틸러스 파일관리자 창에서 접속을 한 뒤 마우스로 끌어서 복사해도 될텐데 왜 내가 command line을 치고 있지?'


왼쪽 맨 아래에서 'Connect to Server'를 클릭하여 나오는 창에 ssh://ip주소:port번호를 입력하면 계정명과 암호를 넣으라는 창이 뜬다. 필요한 정보를 넣고 나면 다음과 같이 창이 열린다.


이렇게 편리한 것을 왜 지금껏 쓰지 않았나 모르겠다. 하지만 MS 윈도우와 리눅스 사이에서 파일을 전송할 때에는 전적으로 sftp(Xmanager Enterprise)만 사용한다. 게으른 탓도 있지만 이것이 좀 더 안전할지도 모른다는 생각에서다. 

Samba를 이용하여 리눅스와 윈도우 사이의 파일 교환 및 프린터 사용을 되게 하느라 고생하던 기억이 새롭다. 당시 사용하던 프린터가 HP DJ505K였던가? alt.binaries.pictures.supermodels 뉴스그룹에서 슈퍼모델 신디 크로퍼드의 사진을 받아서 인쇄했던 기억이 난다. 아이고, 신디 누님은 1966년생이로구나...

리파마이신(rifamycin), 리팜피신(rifampicin), 그리고 리팜핀(rifampin)의 차이

세 가지 용어의 정확한 차이를 알기 위하여 구글에게 물어보았다. 가장 상위 개념이라고 할 수 있는 리파마이신(rifamycin)은 Amycolatopsis rifamycinica(NCBI taxonomy)라는 세균에서 얻어지는 천연 상태의 항생제 혹은 이로부터 유도된 반합성 화합물을 통틀어 일컫는 용어이다. 최초 발견자가 프랑스 범죄소설 를 특히 좋아해서 이 물질을 리파마이신이라 부르기로 했다고 한다. 이것은 1957년의 일이다. 처음에 발견된 것은 리파마이신 A, B, C, D, E의 혼합물이었고 이 중에서 충분히 안정하여 순수하게 분리할 수 있는 것은 오직 리파마이신 B였다. 하지만 효능은 좋지 못하였다. 연구를 지속한 결과 리파마이신 B는 근본적으로 활성이 없지만, 수용액 내에서 자발적인 반응을 거쳐서 효능이 매우 우수한 리파마이신 S가 되고, 이를 환원시키면 하이드로퀴논 형태인 리파마이신 SV가 된다. 리파마이신 SV는 이 계통의 항생제 중에서는 임상에서 처음 쓰인 약이다(주사제).

출처: https://en.wikipedia.org/wiki/Rifamycin
리파마이신은 세균의 RNA polymerase beta subunit에 결합하여 그 작용을 저해함으로써 세균의 성장을 막는 bacteriocidal antibiotic이다. TAQ RNA polymerase와 리팜피신이 결합한 콤플렉스의 입체 구조를 다음의 URL에서 볼 수 있다.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/1YNN

윗부분의 갈색 뭉치가 RNA polymerase 베타 서브유니트이다. 리팜피신은 가운데에 위치한 조그마한 흰색 구조체이다.
1959년에는 효율이 좋고 내약성이 우수한 새로운 분자, 즉 '리팜피신'이 개발되었다. 리팜핀은 리파마이신을 미국에서 부르는 말이라고 한다. 리팜피신은 먹는 약으로서 결핵 치료에 주로 쓰여왔다. 내성이 잘 유발되기에 일반적으로 다른 항생제와 같이 쓰인다고 한다.

리팜피신의 상품 브랜드 명으로는 Rifadin, Rimactane 등이 있다. 리팜피신에 대하여 왜 미국에서만 리팜핀이라는 다른 이름이 생겨났는지는 확인하지 못하였다.

2018년 1월 1일 월요일

독서 기록 - 유발 하라리의 <사피엔스> <호모 데우스> 외 5권

2017년 마지막 주를 남은 연차휴가로 집에서 편하게 보내면서 꼭 읽으리라고 다짐했던 유발 하라리의 책 <사피엔스>와 <호모 데우스>를 드디어 읽었다. 두 권의 책을 합치면 총 1천 페이지를 훨씬 넘는 방대한 분량인데, 약 3일에 걸쳐서 정신없이 읽었다.


<사피엔스>는 인류의 역사를, <호모 데우스(Homo deus; deus = 신)>는 신의 영역에 도달한 인간의 미래를 그린 책이다. <사피엔스>가 폭발적인 인기를 끌고 저자가 방한까지 하자 '한국은 우리의 문제를 남(외국)에서 답하려는 얼빠진 사회'라는 비판까지 일었다. 마치 마이클 샌델의 '정의란 무엇인가'가 우리나라에서 인기를 끌었던 것과 비슷한 현상으로 보려는 것이다. 정작 저자의 나라에서는 별로 주목을 받지 못했던 책이 운좋게 시류에 적절한 순간 출간되어 우리나라에만 인기를 끌면서 수십만권 이상이 팔리고, 이를 무비판적으로 받아들이고, 이러한 반짝 인기에 편승하여 저자의 방한 이벤트를 통해 이득을 보려는 숨겨진 상술을 경계하려는 것이다. 인공지능·빅데이터·제4차 산업혁명에 대한 관심이 요즘 부쩍 높아진 것도 유발 하라리의 책에 대중이 관심을 쏟게 만든 원인 중 하나가 아닐까 한다. 어쩌면 이 주제는 유난히 한국에서만 부상하고 있는지도 모르겠지만 말이다.

[세계일보-박정진의 청신청담] 사피엔스, 인간의 내장된 종말 읽게 해
[한국일보] 사피엔스 저자 유발 하라리는 제국주의자다

여러 부정적인 시각이 있음에도 불구하고 이 두 권의 책은 매우 큰 흡인력을 갖고 있다. 인류의 역사와 미래에 대해서 큰 질문을 던지고 이에 대하여 탐구하듯이 쓴 책은 흔하지 않다고 생각한다. 책을 읽는 내내 '유발 하라리는 역사학자가 맞나? 혹시 IT나 BT 전공자는 아닌가?'하는 생각이 들 지경이었다. 에드워드 윌슨의 <통섭>이나  제래드 다이아몬드의 <총, 균, 쇠>를 연상하지 않을 수가 없었다.

스토리텔링은 유려하지만, '사피엔스'에 구체적인 내용이 없다는 비판도 있다. 아마도 '앞으로 어떻게 하라는 거냐'라는 대안 제시가 부족하다는 뜻으로 받아들여야 할 것이다. 이에 대해서는 후편인 <호모 데우스>를 통해서 '앞으로 어떻게 것이다'에 대한 예측은 충분히 내세웠다고 생각한다. 시나 소설가에게 대안을 제시하라고 할 필요는 없듯이 말이다.

따라서 이 두 권의 책은 반드시 같이 읽어야 한다. <사피엔스>에서는 다른 동물들 사이에서 별볼일 없던 인간이 어떻게 '인지 혁명'을 통해서 지금의 문명을 이루었는지를 서술하였다. 보이지 않는 실재(그것이 비록 허상에 불과한 것이라 하여도)를 동료들에게 인지시키고 이로 말미암아 공동 목표의 달성을 위한 협력을 이끌어낸 것이 지구상에 인간의 세상을 만들어낸 주된 원인으로 파악하였다. 눈에 당장 보이지 않는 실재라는 것인 종교일 수도 있고 국가사회일 수도 있고 공익의 추구일 수도 있다.

<호모 데우스>의 결론 부분을 인용해 본다(맨 마지막쪽인 554쪽).

  1. 과학은 모든 것을 아우르는 하나의 교의로 수렴하고 있고, 이 교의에 따르면 유기체는 알고리즘이며 생명은 하나의 데이터 처리 과정이다.
  2. 지능이 의식에서 분리되고 있다.
  3. 의식은 없지만 지능이 매우 높은 알고리즘이 곧 우리보다 우리 자신을 더 잘 알게 될 것이다.
이에 대해서 인간은 영적인 존재임을 믿는 기독교인들은 강하게 반발할 것이다. 하지만 나는 이 세 가지 결론에 대하여 전적으로 동감한다. 이미 의식과 무관하게 인공적인 지능이 우리 주변에서 필요한 일을 수행하고 있다. 우리가 의식 또는 자아라 믿는 것 자체도 매우 정직하지 못하다는 것이 현대 신경과학의 결론 아니었던가? 

의식, 자아, 감정, 경험, 기억 - 이 모든 것은 신경세포의 발화와 신호전달물질의 정교한 '뒤범벅'에 의한 결과라는 것이 나의 결론이다. 지나친 유물론적인 해석이 아니냐고 비판해도 좋다. 세포와 개체가 단지 유전자의 전달자를 위한 도구('생존 기계' - 리처드 도킨스의 입장)라고 해도 좋다. 물리적·화학적 현상에 우리의 정신 활동이 기반한다고 해서 그것이 무가치하다고 생각하지는 않는다. 어쨌든 나는 외부 자극에 반응하고 무엇인가를 느끼고 있으니까 말이다. 그리고 나를 포함한 되도록 많은 사람들이 행복한 감정을 느끼면서 살아가도록 노력하고 협력하는 것은 분명히 의미있는 일이다. 

나머지 책은 제목과 저자를 소개하는 선에서 간략하게 끝내기로 한다.
  • 역사학자 정기문의 식사(食史) - 생존에서 쾌락으로 이어진 음식의 연대기
  • 명견만리 우리가 준비해야 할 미래의 기회를 말하다 (윤리, 기술, 중국, 교육 편) - KBS <명견만리> 제작팀 지음
  • 츠바키 문구점 - 오가와 이토 지음|권남희 옮김. 나의 얄팍한 경험으로 일본의 문화예술을 논한다는 것은 대단히 부적절할 것이다. <심야 식당> <앙: 단팥 인생 이야기> <세상의 끝에서 커피 한 잔> 등 내가 보았던 일본 영화의 중요 공식이 잘 나타난 소설이다. 즉 소소한 일상, 가업, 음식에 대한 상세한 묘사, 힐링이 되는 분위기 등. 이 소설은 주인공 하메미야 하토코는 도쿄에서 멀지 않은 가마쿠라에서 문구점을 운영한다(이 문구점은 가공의 것이지만 소설에서 소개된 관광지, 절, 음식점 등은 실제 존재하는 곳이다). 주인공이 물려받은 가업은 대필, 즉 고객이 의뢰한 편지를 대신 써 주는 일이다. 연말에는 연하장과 같은 의례적인 편지를 쓰느라 몹시 바쁘다. 하지만 지인이 키우던 원숭이가 죽은 것을 위로하는 조문 편지, 주변 사람들에게 의뢰자 부부가 이혼했음을 알리는 편지, 돈을 빌려달라는 부탁을 거절하는 편지 등 저마다의 사연을 가진 의뢰자가 츠바키 문구점을 찾아서 차 한잔을 앞에 놓고 마음을 열면서 필요한 편지 내용을 알려주고, 주인공은 의뢰자의 마음이 되어서 편지를 공들여 쓴다. 대부분의 경우 편지의 최종안을 의뢰인이 확인하지는 않는다. 그만큼 대필가를 신뢰한다는 뜻이 될 것이다. 주인공이 어떤 펜과 잉크, 종이, 봉투 및 우표를 사용했는지에 대한 상세히 설명한 것이 이채로왔고, 일년에 한 번 의뢰인이 편지를 보내주면(예를 들어 젊은 시절 주고받은 러브레터를 언제나 갖고 있을 수도 없고, 쓰레기통에 버릴 수도 없는 노릇이니) 이를 정성스럽게 태우는 의식을 치러준다는 것도 나의 흥미를 끌었다. 수고비는 미사용 우표를 같이 부치는 것으로 대신한다. 권 말미에는 소설 속에서 쓴 손글씨 편지가 소개되었다. 읽으면서 마음이 따뜻해지는 소설이었다.
  • 세월호 참사 팩트체크: 밝혀진 것과 밝혀야 할 것 - 416세월호참사 국민조사위원회 지음
  • 사라지는 미래 인구축소가 가져오는 경제와 시장의 대변환 - 김성일, 정창호 지음. 시장 없는 인구는 존재해도, 인구 없는 시장은 존재하지 않는다. 우리가 미처 신경을 쓰지 못하는 동안 우리나라의 인구 구조는 도저히 되돌릴 수 없는 상태로 비가역적인 변화를 겪고 말았다. 인구 축소 = 시장 축소의 데모-디플레이션 시대를 맞이한 것이다. 이제 성장을 최고의 가치로 삼던 , 즉 팽창의 경제 시대는 다시 오지 않을 것이다. 이에 대한 해결책 중 하나로 기업 소득 환류 세제(기업의 사내 보유 현금성 자산에 대한 과세)를 제시하였으며, 아이를 낳은 엄마를 존경하는 사회 분위기 조성이 필요함을 열설하였다.

2018년 새해 벽두부터 끊이지 않는 자잘한 사고

가족 여행을 갔다가 면도기에 손가락을 베고,
딸아이는 휴대폰을 잃어버렸다가 되찾고(블로그 포스트 링크),
자다가 아내의 팔꿈치에 부딛혀서 입술이 터지고,
새해 첫날부터 깨진 변기 백시멘트 보수 작업을 하다가 물탱크에 물을 공급하는 수도꼭지를 잘못 건드려 배관이 파손되고...
이 '재앙'은 현재진행형이다. 냉수를 차단할 수밖에 없어서 난민촌이다 다를 바가 없는 상황이 되고 말았다. 타일을 깨고 수도관 접합부를 드러내는 대공사가 벌어질지도 모른다.
이것 말고도 공개하기 어려운 가정 사정이 발생하고...

새해를 맞이하여 특별히 다짐을 한 것도 없이 평소와 다름없는 새날을 맞으리라고 생각했는데 시작부터 의욕이 꺾이는 일이 이렇게 많이 발생할 줄은 정말 몰랐다.

그래도 어쩌랴. 어떻게든 살아 나가야 한다.