Methylomonas denitrificans is not an approved species name

Methylomonas는 Gammaproteobacteria에 속하는 그람 음성 세균으로서 메탄이나 메탄올과 같은 매우 단순한 C1 화합물을 이용하는 aerobic bacteria이다. C1 화합물을 산화시켜서(최종 전자 수용체는 산소) 에너지를 얻음과 동시에 탄소원으로도 사용한다. C-C 결합이 있는 유기물로는 성장을 하지 못한다. Type species는 Methylomonas methanica이다.

Methylomonas koyamae와 관련한 comparative genomic analysis를 하다가 서로 다른 두 species의 ANI가 100%에 육박하는 것을 발견하였다. 하나는 Methylomonas methanica, 나머지는 Methylomonas denitrificans이다. 둘 다 type strain인데 gANI로는 100%가 나왔다. EzBioCloud Identify에서 확인한 pairwise 16S rRNA gene sequence similarity는 98.9%(16/1449)였다. ANI에 비하여 16S rRNA sequence의 차이는 좀 큰 편이다.

Methylomonas denitrificans FJG1(T)를 최초로 보고한 논문을 찾아보았다. 유전체 서열도 이 논문을 통하여 같이 공개하였다.

Methane oxidation coupled to nitrate reduction under hypoxia by the Gammaproteobacterium Methylomonas denitrificans, sp. nov. type strain FJG1. Environ. Microbiol. 2015 (PubMed)

초록만으로는 신종 보고를 위해 필요한 제반 실험을 다 한 것인지 알기가 어려웠다. 일단 도서관에 원문복사신청을 하였다. Methylomonas methanica의 최초 유전체 정보가 공개된 것은 2011년 5월(strain MC09)이고 type strain인 R-45363에 대한 것은 2016년이다. 따라서 Methylomonas denitrificans FJG1 논문을 투고할 시점에는 ANI analysis를 할만한 Methylomonas methanica type strain의 유전체 정보가 공개되지 않았던 것으로 볼 수 있다. 그렇다 해도 FJG1을 신종으로 보고하려면 DDH 실험을 했었어야 할 것이다.

DSMZ의 Prokaryotic Nomenclautre Up-to-data에서 Methylomonas genus의 공인된 종을 찾아보았다. Methylomonas denitrificans는 아직 등재되지 않았다.

다른 종의 type strain과 유전체가 100% 수준으로 똑같다면 신종의 자격을 얻는 것은 불가능할 것이다. 다만 두 균주 사이에서 16S rRNA sequence similarity가 <99 draft="" fjg1="" p="">