Consed 19.0에서 달라진 점

이건 뭐... 뒷북도 한참 뒷북이지만 어쨌든 정리해 보자. 사소한 버그 수정은 중요하지 않고, 새로 더해진 기능 중에서 가장 중요한 것은 Assembly view에서 Solexa read를 볼 수 있다는 것이다. 우리 연구실에서 Solexa data를 생산한 적은 있지만 실제 분석은 지금 ISB에 가 있는 윤성호 박사가 했었다. 당시 Maq(http://maq.sourceforge.net/)를 썼던 것으로 기억하는데, consed 19.0이 이 기능을 대신할 수 있는지는 잘 모르겠다.

엄청난 분량의 README 파일을 읽으려니 엄두가 나지 않는다. 하지만 나 스스로 consed의 고급 사용자라 자부하고 있으므로, 다음의 부분만 읽으면 되겠다.

• USING SOLEXA READS
• ADDING SOLEXA READS
• ALIGNING SOLEXA READS AGAINST A LARGE GENOME AND SELECTING A SMALL REGION FOR VIEWING WITH CONSED
• USING YOUR OWN SOLEXA DATA
• USING 454 READS (NEWBLER ASSEMBLY)
• USING 454'S NEWBLER ON YOUR OWN DATA
• USING 454 READS (ALIGNING TO REFERENCE SEQUENCE )
• ADDING ADDITIONAL 454 OR SOLEXA READS
• SOLEXA AND 454 DATA--WHAT IS HAPPENING BEHIND THE SCENES
• USING AUTOREPORT