2018년 3월 29일 목요일

블로그에 애드센스 광고 게재 시작

›
지난 주말에 전주에 다녀온 것이 약간 무리였었던 것 같다. 감기몸살 증세가 나타나기 시작하여 서 나는 그저께 오후부터 맥을 못추고 있고, 아내도 슬슬 몸이 안좋다고 한다. 전주에 가면 외지에서 온 관광객들이 붐비는 한옥마을만 거니는 것이 아니라 종...
2018년 3월 27일 화요일

Barrnap 결과물(GFF3)에서 16S rRNA 서열만 뽑아내기

›
Barrnap(BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor, 링크 )를 사용하여 박테리아의 유전체 서열로부터 ribosomal RNA를 예측하였다. 결과물은 GFF3 파일이다. 여기에서 16S rRNA sequence를 뽑아내려면...
2018년 3월 26일 월요일

Conda, Anaconda, Bioconda 기초

›
서버의 운영체제를 CenOS 6.9에서 7.4로 업그레이드하면서 여러 응용프로램을 효율적으로 관리할 방안을 고민하게 되었고, 이에 따라서 자연스럽게 conda를 공부하게 되었다. 앞으로는 Linuxbrew에서 조금씩 멀어지게 될 것만 같다. 전혀 관...
2018년 3월 25일 일요일

TDA7265 앰플리파이어 속판 작업

›
트랜스는 자리를 잘 잡았는데 앰프 기판은 똑바로 놓이질 못하였다. 왜 구멍도 제대로 뚫지 못하는가!  오늘 작업한 것은 사진으로는 그다지 눈에 뜨이지 않는다. 케이스 속판(알루미늄)을 구입하여 전원트랜스포머와 기판을 그 위에 고정하였다. 이전...

독서 기록 - [이 세계의 식탁을 차리는 이는 누구인가] 외 2권

›
총 네 권의 사진을 찍었지만 '부자의 시간(최윤식 지음)'은 끝까지 읽는데 실패하였다. 다음에 꼭 다시 도전할 생각이다. 저자가 밝히기로는 이 책을 쓴 목적은 부의 흐름을 통찰할 수 있는 지식과 방법을 소개하는 것이라고 했다. 그러...
2018년 3월 23일 금요일

[CentOS 7] root가 설치한 perl module은 어디로 갔는가?

›
사용하던 서버 중 하나를 CenOS 7.4.1708로 업그레이드한 다음 필요한 프로그램을 설치하면서 CentOS 6과는 얼마나 달라졌는지를 체험해 나가고 있다. Python, R, 생명정보분석용 프로그램의 관리에는 Conda 를 시험삼아 쓰기 시작하...
2018년 3월 21일 수요일

Bio-Linux 8.0.7(Ubuntu 14.04.5 LTS 기반)에 pyenv 설치하기

›
지금껏 CentOS 6.9를 사용해 오다가 7.3-1611로 업데이트를 위한 준비를 진행하고 있다. GCC와 python 등의 버전 문제로 꼭 필요한 응용프로그램을 실행하는데 많은 불편함이 있었다. Linuxbrew 와 pyenv 등이 뒤죽박죽된 아...