2018년 2월 23일 금요일

감동의 iTOL(Interactive Tree Of Life)

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iTOL( http://itol.embl.de/ )은 계통수를 시각화, 주석화 및 관리하는 도구이다. 웹 인터페이스로 구성되어 있어서 누구나 tree file을 올린 다음 다채로운 annotation을 할 수 있다. 계통수 곁에 배열할 데이터가 많거나...
2018년 2월 21일 수요일

[하루에 한 R] ANI 계산 결과 다루기 - column 혹은 row 이름을 통한 조작

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R을 이용해서 '4차 산업혁명' '빅데이터' 시대에 걸맞는 거창한 일 - 말하자면 방대한 데이터 속에서 새로운 지혜를 발굴하는 - 을 해야 하는데, 아직까지도 기초 수준의 자료 작성 기법을 익히는데 머물고 있으니 어찌 한심...
2018년 2월 19일 월요일

삼미 HA-165B60 스피커통의 개조 - 후면 개방형으로 바꾸어보다

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삼미 HA-165B60 스피커 유닛(소위 6.5인치; 삼미스피커 주식회사의 제품소개 링크 )는 Hi-Fi와는 거리가 먼 제품이다. 천장에 묻어서 구내 방송용으로 쓰거나, 게임기나 앰프 등에 수납할 용도로 제조되는 유닛이다. 능률이 높고 전 대역을 평탄...
2018년 2월 18일 일요일

R 코드를 위한 Syntax Highlighting

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드디어 Syntax Highlighting을 사용하여 구글 블로거에서 R code를 예쁘게(?) 표현하는 방법을 찾았다. Perl과 Bash에 대해서는 쓰는 방법을 대충 알아낸 상태였었다. 나에게 도움을 준 페이지는 다음의 것이다. 블로거(b...
2018년 2월 15일 목요일

무엇이 옳은가

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일제 강점기가 끝나고 군정치하에서 남한이 단독으로 정부 수립을 준비할 때 일제에 부역했던 많은 사람들에 대한 청산이 이루어지지 못했음을 우리는 잘 알고 있다. 이러한 불행한 잔재는 지금까지도 고스란히 남아서 한국 사회 곳곳에서 아직 해소되지 않은 갈등...

이영건 선생님이 제작한 6J6 푸시풀 앰프 앰프를 주문하다

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소리전자 판매장터의 자작품 장터 게시판을 구경하다가 이영건 선생님께서 올린 소출력 앰프 판매 글을 접하게 되었다. 마침 사무실 책상 앞에서 잔잔하게 음악을 을려줄 TDA7265-LM1876의 뒤를 이을 '세번째'의 앰프를 찾는 중이었고,...
2018년 2월 13일 화요일

왜 GenBank에 존재하는 일부 bacterial genome이 RefSeq에는 존재하지 않는가?

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요즘 Paenibacillus genus에 속하는 균주의 comparative genomics 분석을 수행하면서 천랩의 EZBioCloud를 많이 참고하고 있다. 여기에서는 GenBank에 공개된 유전체를 가져다가 자체적으로 QC를 실시하여 특정 sp...