2018년 1월 31일 수요일

[하루에 한 R] PhyloSift 결과 종합하기(merge 함수로 tab-delimited CSV 파일의 일괄 입력 및 병합 등)

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Species boundary를 살짝 넘어가는 박테리아 유전체 50개 정도를 가지고 whole genome phylogenetic tree를 그려보고자 하였다. Harvest suite 로 분석을 하면 MUMi distance cutoff에 미치지 못...
2018년 1월 30일 화요일

또 진공관 앰프?

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<성장 없는 번영>이라는 책을 다 읽고 나니 '소비'라는 행위를 뒤돌아보게 되었다. 우리 주위에는 '제발 나를 쇼핑해 달라고' 외치는 갖은 유혹이 얼마나 많은가? 이제는 필요 에 의해서 구입을 하는 것이 아니라 ...
댓글 2개:
2018년 1월 27일 토요일

독서 기록 - <나를 믿어주는 한 사람의 힘> 외 네 권

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이번에는 대출 기한을 일주일 연장했음에도 불구하고 대출한 책을 다 읽지 못하였다. <처음 읽는 일본사(전국역사교사모음 지음)>, <불평등의 역사(발터 샤이델 저|조미현 역)>, 그리고 <스트레스는 어떻게 삶을 이롭게 하는가(...

소화전함이 수령한 택배 배달 물건

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집에 사람이 없을 때 아주 가끔 소화전함에 물건을 넣어두었다는 문자 메시지를 받을 때가 있다. 바쁜 택배 기사들의 입장을 생각하면 이해하지 못할 일은 아니지만 물건이 없어진 경우 책임 소재의 문제가 따른다. 만약 나쁜 마음을 먹은 사람이 아파트에 들어...
2018년 1월 26일 금요일

NCBI에서 대량의 미생물 유전체 정보 다운로드하는 요령 - 업데이트

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몇 번에 걸쳐서 유전체 정보의 일괄 다운로드(전체 혹은 선별된 것) 방법을 블로그에 작성한 적이 있다. 항상 일정한 위치에 업데이트된 상태로 존재하는 assembly summary 파일을 받아서 선택한 유전체의 FTP 주소 base를 얻어낸 다음 이...
2018년 1월 23일 화요일

Adaptive mutations in bacteria

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제목을 써 놓고 보니 덜컥 겁이 난다. 내가 과연 이 어려운 제목에 합당한 블로그 포스팅을 성공적으로 마칠 수 있을까? 나 자신이 과연 이 개념을 제대로 이해하고나 있을까? 결국은 '진화'라는 주제로 접근해 가야 하는데, 모든 자연과학의...

감각은 간사하다

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왜냐하면 새롭고 참신한 것에 쉽게 빠져들기 때문이다. 그래서 과거부터 믿고 아껴오던 것을 쉽게 내치는 결과를 낳는다. 그래봐야 '한계효용체감의 법칙'에 따라서 다시 평상시와 다름없는 만족도 수준으로 돌아가게 된다. 그것이 인간의 신경 회...