2017년 10월 28일 토요일

독서 기록 - 이주하는 인간, 호모 미그란스(조일준 저)

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독서 기록을 쓰려면 책을 바로 옆에 두고 뒤적거리면서 기억이 남는 부분을 다시 찾아보아야 하는데 하필이면 오늘이 반납 마감일이라서 도서관에 가서 책을 돌려주어야만 했다. 미리 찍어 놓은 표지 사진, 기억, 그리고 인터넷의 자료를 보고 더듬더듬 글을 적...
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2017년 10월 26일 목요일

J. H. Clippinger의 강연 <제4차 산업혁명과 바이오산업 트렌트>와 그 뒷이야기

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어제 개최되었던 2017 바이오 미래 포럼 에서 미국 MIT 미디어랩 '교수'인 J. H. Clippinger 교수의 강연이 있었다. Clippinger(클리핀저? 클리핑거? 클리핑어?)는 대전광역시에서 주최하는 세계과학 문화포럼 2일차...
2017년 10월 24일 화요일

EndNote X8 오류 '범위를 편집할 수 없습니다'의 해결

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EndNote는 논문을 쓸 때 참고문헌을 정리하는 프로그램이다. 처음에는 MS 워드에서만 작동이 되었지만, 이제는 한/글(HWP)에서도 사용 가능한 것 같다( 링크 ). 오픈오피스나 리브레오피스에서도 아마 될 것으로 생각되지만 사용법을 알아보지는 않았...
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[PacBio sequencing] HGAP version 확인하기

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HGAP (hierarchical genome-assembly process, Nature Methods 2013년도 논문 )은 PacBio data를 nonhybrid 방식, 즉 일루미나와 같은 short read의 도움 없이 스스로 교정을 하여 유...
2017년 10월 21일 토요일

독서 기록

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일주일 동안 총 다섯 권의 책을 읽었고 지금은 여섯 번째의 책 <이주하는 인간, 호모 미그란스>를 읽는 중이다. 왼쪽 위부터 시계 방향으로 간단히 느낀 점을 적어본다 나와 세계 Comparing human societies ...
2017년 10월 20일 금요일

Strain, clone and species

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어제 Bacillus 에 속하는 세균 한 건의 BioProject/BioSample/Genome/SRA 4종 세트를 NCBI에 등록하였다. 매번 느끼는 일이지만 submission portal에 접속을 해보면 사용자 인터페이스가 아주 조금씩 바뀐 것을...
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2017년 10월 18일 수요일

새롭게 공부하는 RNA-seq data analysis

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늘 세균의 genome(sequencing & analysis)만 편식하다가 인체 세포주에서 유래한 RNA-seq data를 건드릴 기회가 생겼다. 아주 드물게 진핵생명체의 RNA-seq data를 다룬 경험이 있지만 워낙 빈도가 적어서 기법을...
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