2017년 3월 28일 화요일

Bracken: Baysian Reestimation of Abundance with Kraken

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Whole-genome shotgun sequencing 방식의 metagenomics에서 read(or contig)의 분류(또는 binning)과 더불어 중요한 목표는 군집을 이루는 각 미생물의 abundance를 추정하는 것이다. 즉 실제 미생물...
2017년 3월 20일 월요일

진도항에 다녀오다

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2014년 4월 16일. 대한민국의 모든 사람들은 날짜를 이날 전으로 돌리고 싶은 심정일 것이다. 만약 그날 모두가 다른 선택을 할 수 있었다면, 아이들이 어른들의 말을 듣지 않았다면, 우리 사회가 좀 더 성숙한 상태였다면, 그러면 이런 참사는 벌어지...
2017년 3월 17일 금요일

FALCON assembler 익히기

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FALCON과 FALCON-unzip은 PacBio long read를 이용하는 de novo assembler 프로그램이다. FALCON-unzip은 진정한 의미의 diploid assembler이다. FALCON의 실행을 위한 파이썬 버전 문제, ...
2017년 3월 11일 토요일

시계 줄질하기

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줄질이란 손목시계의 줄을 손수 바꾸어 끼는 것을 말한다. 바넷봉(Barnett rods)의 구조와 이것이 시계 몸통에 끼워지는 원리를 알면 누구나 쉽게 할 수 있는 일이다. 요령이 있으면 전용 공구 없이도 커터칼 같은 것으로 바넷봉을 빼고 끼울 수는 ...
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2017년 3월 3일 금요일

오리엔트 시계 FEM7P007B9 구입 및 수령기

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화요일 저녁무렵이 다 되어서 Creation Watches 에서 주문한 시계가 만 48시간이 되기도 전에 나에게 도착하였다. DHL을 통해서 싱가폴에서 한국까지 단숨에 배송이 된 것이다. 옥션이나 11번가 등을 이용하여 국내에서 물건을 산 것과 무엇이...
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맥북 프로 첫걸음, 가야 할 길인가 혹은 아닌가?

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바로 옆 사무실의 동료가 대학으로 직장을 옮기면서 꽤 많은 컴퓨터와 모니터를 넘겨받게 되었다. 비좁은 사무실에서 나는 완전히 대형 모니터들로 포위된 꼴이 되고 말았다. 공교롭게도 바로 지난주에 장렬히 전사한 CrossOver 대형 모니터까지 아직 치우...
2017년 2월 28일 화요일

생애 최초의 시계 해외 직구(Orient)

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무엇인가를 사고 싶어서 인터넷을 열심히 뒤질 때가 있다. 아니, 좀 더 솔직해지자. 무엇인가를 사기 위해 항상 인터넷을 뒤지고 있다고 고백하자. 단지 그 관심 대상이 바뀔 뿐이다. 지난 25년(혹은 그 이상?)을 회상해보니 사진기와 렌즈, 망원경, 기...