2015년 9월 25일 금요일

CEGMA 환경 설정 마무리 및 첫 실행

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이전 포스팅 에서도 언급했듯이 CEGMA는 유전체 조립의 완결성을 검증하는 도구가 아니고 - 그런 목적으로 사용해도 되지만 - 미리 확정된 ultra-conserved gene의 구조를 새로운 유전체 서열로부터 찾는 것을 기본 목적으로 한다. CEGM...

CEGMA와 BUSCO란? 그리고 WIse2 패키지(genewise) 설치

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Genome assembly의 완결성을 점검하기 위하여 모든 유전체라면 능히 가지고 있어야할 핵심 유전자가 assembly 내에 있는지를 확인하는 작업이 종종 필요하다. 특히 novel eukaryotic genome이라면 더 그러하다. 2007년도에...
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2015년 9월 24일 목요일

Yeast Genome Annotation Pipeline(YGAP)에 대해 알아보기

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가끔 효모 유전체 시퀀싱 결과를 다루어야 할 때가 있다. 이때 내가 종종 이용하는 웹 서비스가 바로 YGAP (Yeast Genome Annotation Pipeline)이다. 이 서비스에서는 주석화가 매우 잘 되어있는 기존의 효모 유전체 정보를 이용...
2015년 9월 23일 수요일

LM1876 앰프 제작을 위한 부품 수급

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오늘 알리익스프레스의 판매자가 LM1876 앰프보드(오늘 현재 유효한 링크 )의 shipping을 하였다는 메일이 도착하였다. 8일 내에 선적을 한다고 겁을(?) 주었는데 생각보다는 빨리 처리가 되고 있다. 월요일에 아세아전원 에 주문한 100VA급 ...

만년필과 잉크의 궁합도 있는가?

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며칠 전 잉크가 잘 나오지 않는 만년필을 바꿔야 되겠다는 취지의 글을 작성한 적이 있다. 플래티그넘 만년필 사용한지 일 년 만에 작별을 고해야 하는가? 그런데 문득 느낀 바가 있어서 실험을 한가지 해 보기로 하였다. 어쩌면 파커 '큉크...
2015년 9월 20일 일요일

FM 안테나 설치 상태 변경

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동쪽으로 향하게 잘못 설치한 FM 안테나를 180도 돌려서 서쪽을 향하게 만들었다. 실제로 달라진 것은 도파기(director)의 위치가 바뀐 것에 불과하다. 이제 서쪽 계룡산 송신소에서 송출되는 KBS 대전 FM의 수신이 최적화되었을 것으로 믿는다....
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2015년 9월 19일 토요일

TDA7297(15 W + 15 W) 앰프를 위한 케이스 구상

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반찬통 속에 볼썽사납게 들어있던 TDA7297 앰프 보드는 요즘 부품통 안에 관심을 받지 못한 상태로 담겨있다. 망가진 3.5 mm 스테레오 폰잭을 공들여 수선해 놓고도 다른 칩앰프들에 가려서 빛을 보지 못한다. 이대로 두기는 아까와서 이를 수납할...