2013년 2월 28일 목요일

TopHat 옵션 관련한 잡설

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글 하나만 올리고 퇴근하자... TopHat 매뉴얼 을 숙독하면서 나름대로 중요하다고 생각되는 사항을 잊어버리기 전에 정리해 본다. ... The software is optimized for reads 75 bp or longer. 괜히 ...
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2013년 2월 27일 수요일

우분투 10.x에 Crossover 모니터(30Q3 PRO) 설치

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설치에 성공했다는 것은 아니고, 이제 해 보려 한다는 뜻이다. 거의 일주일 넘게 blast2go 작업을 하느라 컴퓨터를 재부팅할 기회가 없었다. 현재는 다음과 같이 듀얼 모니터를 쓰고 있다. LG L226W 1680 x 1050 LG L195...

tophat mapping statistics와 관련한 수수께끼

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tophat-cufflinks pipeline을 이용하여 RNA-seq data에 대한 분석을 시도하였다. 총 여섯 개의 Illumina data file을 매핑하였는데, 이 중에서 3개 결과가 좀 이상하다. 예를 들어 3400만개의 read가 투입되...
2013년 2월 16일 토요일

또 LVM의 디스크 오류 발생

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LVM을 이용하여 묶어 놓은 다섯 개의 디스크(씨게이트 바라쿠다 2TB) 중 또 하나가 문제를 일으켰다. 동일 HDD에서 벌써 세번째의 오류던가... 다행히 인텔리전트한 OS께서는 입출력 오류가 나는 즉시 문제의 로지컬 볼륨을 read-only 상태로...
2013년 2월 12일 화요일

BioPerl을 찾아서...

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근무 부서를 옮기고, 설치와 유지 보수 때문에 신경을 쓸 필요가 없는 고급(?) 컴퓨터에 계정을 개설하였다. Sun Grid Engine 환경에서 예전과는 비교할 수 없이 빠른 속도로 작업을 수행하게 되니 정말 놀랍기만 하다. 관리자와 일반 사용자...
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2013년 2월 3일 일요일

오랜만에 간단한 목공을...

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예전에 코팅합판을 구입하여 건반 받침을 만든 일이 있었다. 그 뒤에 철제 스탠드를 사게 되면서 합판을 해체하여 발코니에 쌓아 두었었다. 며칠 전에 건반을 거실로 내놓으면서 스피커를 놓을 공간이 필요하게 되었다. 코팅합판을 잘라서 목공본드로 접합면을 보...
2013년 2월 1일 금요일

옴니아팝에 스카이프 설치하기

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국외 출장을 갔을 때를 대비하여 옴니아팝에 스카이프를 설치하기 위해 갖은 애를 쓴 끝에 어렵게 성공하였다. 아무리 좋은 앱이라 해도 내 단말기에 설치를 하지 못한다면 무슨 소용이 있겠는가. 더군다나 윈도우 모바일 6.5용의 설치 파일을 찾는 것은 정말...