2012년 10월 31일 수요일

[R-project] rep() 함수 활용

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KOBIC이 주최하는 제12차 차세대 생명정보학 교육에 참석 중이다. 김상철 박사가 강의하는 R 강좌를 올해 들어 두번째 듣고 있다. 자기의 데이터를 가지고 실제 코딩을 해 봐야 실력이 늘 텐데, 게으름에 차일피일 미루다 보니 좀처럼 잘 되지 않는다....
2012년 10월 28일 일요일

[Perl programming] map() 함수

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map-sort-map 함수를 사용한 배열 처리 기법(Schwartzian transformation)을 가끔 사용하면서도, map의 정확한 사용법을 잘 모르고 있었다. map 함수는 인수로 주어진 배열의 모든 원소에 대하여 작업을 수행한 뒤, 그 결...
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2012년 10월 20일 토요일

대전시민천문대에 대한 쓴소리

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초등생 딸아이가 오랜만에 천문대에 가 보고 싶다고 하여 아내와 함께 셋이서 대전시민천문대를 찾았다. 일년에 몇 번씩은 들르는 곳이었지만 이번 방문은 상당히 오랜만이라서 나름대로의 기대를 갖고 갔다. 그러나 그동안의 방문 중에서 가장 성의 없고 불친절한...
2012년 10월 19일 금요일

삼성 피처폰 - 노리폰

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딸아이가 쓰다가 버린(?) 피처폰. 10-20대 여성을 겨냥하여 출시되었던 작고 아기자기한 휴대폰이다. 과연 내가 스마트폰을 가지고 얼마나 스마트하게 살고 있나? 전화기는 영리하게(smart) 진화했지만 이를 쓰는 나는 더 dumb해진 것이 ...

화성으로 DNA sequencer를 보내자!

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GenomeWeb에서 보내는 The Daily Scan을 보다가 재미있는 뉴스를 발견했다. 유명한 크레이그 벤터와 Ion Torrent의 설립자인 조나단 로스버그가 화성에 DNA 염기서열 해독장치를 보내고 싶어한다는 것이다. 우주인을 훈련시켜서 화성까...
2012년 10월 16일 화요일

MicrobeDB

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미생물 유전체를 늘 다루면서 GenBank file이나 tab-delimited file에서 필요한 정보를 추출하기 위해 매번 Perl 스크립트를 짜는 것을 번거롭게 생각하고 있었다. BioPerl을 같이 사용하기에 많은 수고를 덜 수는 있지만, 반복...
2012년 10월 12일 금요일

컴퓨터와 씨름하며 보낸 일주일

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두 대의 컴퓨터, 그리고 리눅스 배포판이 담긴 CD/DVD-ROM 6장. 창고로 들어가 버릴 수도 있었던 컴퓨터를 잘 살려냈다. 온갖 배포판을 전전한 끝에 Fedora 17과 Xubuntu 12.04로 잘 마무리가 되었다. 역시 리눅스를 제대로 쓰려면...